it.wikipedia.org

Phycodnaviridae - Wikipedia

Da Wikipedia, l'enciclopedia libera.

Come leggere il tassobox
Come leggere il tassobox
Phycodnavirus
Immagine di Phycodnaviridae mancante
Classificazione scientifica
DominioVaridnaviria
RegnoBamfordvirae
PhylumNucleocytoviricota
ClasseMegaviricetes
OrdineAlgavirales
FamigliaPhycodnaviridae
Genere
Chlorovirus

Coccolithovirus
Prasinovirus
Prymnesiovirus
Phaeovirus
Raphidovirus

Phycodnaviridae è una famiglia di grandi (da 160 a 560 000 coppie di basi) virus a DNA a doppio filamento che infettano alghe eucariote di acqua dolce e salata. I Phycodnaviridae hanno una morfologia icosaedrica del capside, una membrana lipidica interna e si replicano, completamente o parzialmente, nel citoplasma della loro cellula ospite. È l'unica famiglia dell'ordine Algavirales e appartiene al phylum di grandi virus noti come Nucleocytoviricota o grandi virus nucleo-citoplasmatici a DNA (NCLDV).

Recenti studi hanno rivelato caratteristiche peculiari nel genoma dei Phycodnaviridae come sofisticati sistemi di replicazione del DNA e apparati di trascrizione, un nuovo tipo di proteina di trasporto del potassio, geni coinvolti nel controllo del processo apoptodico del genoma della vittima e geni per la glicosilazione delle proteine virali.

Tutti i Phycodnaviridae codificano per un certo numero di proteine coinvolte nei processi di replicazione o ricombinazione del DNA, compresa una DNA polimerasi (DNA-dipendente) diretta. Non è ancora chiaro se alcuni dei Phycodnaviridae posseggano un apparato di replicazione completo e funzionale, comunque. Essi sembrano infatti fare affidamento, almeno parzialmente, sugli enzimi prodotti dalla cellula ospite.

  • Van Etten JL. Unusual life style of giant chlorella viruses. Annu Rev Genet. 2003;37:153-95. Review. PMID 14616059
  • Van Etten JL, Meints RH. Giant viruses infecting algae. Annu Rev Microbiol. 1999;53:447-94. Review. PMID 10547698
  • Iyer LM, Balaji S, Koonin EV, Aravind L. Evolutionary genomics of nucleo-cytoplasmic large DNA viruses. Virus Reseearch. 2006 Apr;117(1):156-84. PMID 16494962
  • Raoult D, Audic S, Robert C, Abergel C, Renesto P, Ogata H, La Scola B, Suzan M, Claverie JM. The 1.2-megabase genome sequence of Mimivirus. Science. 2004 Nov 19;306(5700):1344-50. PMID 15486256

V · D · M

Classificazione di Baltimore
Tipo di virus
Gruppi
OrdiniFamiglie
DNA
I: virus a dsDNA
CaudoviralesMyoviridae · Podoviridae · Siphoviridae
HerpesviralesAlloherpesviridae · Herpesviridae · Malacoherpesviridae
Ordine non assegnatoAscoviridae · Adenoviridae · Ampullaviridae · Asfarviridae · Baculoviridae · Bicaudaviridae · Coccolithovirus · Corticoviridae · Fuselloviridae · Globuloviridae · Guttaviridae · Iridoviridae · Lipothrixviridae · Mimiviridae · Nimaviridae · Pandoravirus · Papillomaviridae · Phycodnaviridae · Plasmaviridae · Polydnaviridae · Polyomaviridae · Poxviridae · Rudiviridae · Tectiviridae
II: virus a ssDNA
Ordine non assegnatoAnelloviridae · Circoviridae · Geminiviridae · Inoviridae · Microviridae · Nanoviridae · Parvoviridae · Virgaviridae
RNA
III: virus a dsRNA
Ordine non assegnatoBirnaviridae · Chrysoviridae · Cystoviridae · Endornaviridae · Hypoviridae · Partitiviridae · Picobirnaviridae · Reoviridae · Totiviridae
IV: virus a ssRNA+
NidoviralesAbyssoviridae · Arteriviridae · Coronaviridae · Medioniviridae · Mesoniviridae · Mononiviridae · Roniviridae · Euroniviridae · Tobaniviridae
PicornaviralesDicistroviridae · Iflaviridae · Marnaviridae · Picornaviridae · Secoviridae
TymoviralesAlphaflexiviridae · Betaflexiviridae · Gammaflexiviridae · Tymoviridae
Ordine non assegnatoAstroviridae · Barnaviridae · Bromoviridae · Caliciviridae · Closteroviridae · Comoviridae · Flaviviridae · Hepeviridae · Leviviricetes · Luteoviridae · Narnaviridae · Nodaviridae · Potyviridae · Sequiviridae · Tetraviridae · Alphavirus · Tombusviridae
V: virus a ssRNA-
MononegaviralesBornaviridae · Filoviridae · Paramyxoviridae · Rhabdoviridae
BunyaviralesCruliviridae · Fimoviridae · Hantaviridae · Leishbunyaviridae · Mypoviridae · Nairoviridae · Peribunyaviridae · Phasmaviridae · Phenuiviridae · Wupedeviridae
Ordine non assegnatoArenaviridae · Ophioviridae · Orthomyxoviridae
RT
VI: retrovirus a ssRNA
Ordine non assegnatoMetaviridae · Pseudoviridae · Retroviridae
VII: retrovirus a dsDNA
Ordine non assegnatoHepadnaviridae · Caulimoviridae
Viroidi
Gruppo non assegnato
Ordine non assegnatoAvsunviroidae · Pospiviroidae
Virus · Classificazione dei virus · Classificazione di Baltimore

V · D · M

Virologia
Componenti viraliCapside · Capsomero · Pericapside · Peplomero
Replicazione viraleCiclo litico e lisogeno · Provirus · Profago · Virione
Classificazione dei virusClassificazione di Baltimore · International Committee on Taxonomy of Viruses · Teoria delle quasispecie
ClinicaMalattie infettive virali · Viremia · Titolazione virale · Antivirale · Oncovirus
Organismi parassitatiViroma umano · Medicina · Medicina veterinaria · Fitovirus · Micovirus · Batteriofagi · Virofagi